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作者:張夢然 來源:科技日報 發布時間:2020/6/1 9:24:26
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迄今最大規模人類遺傳變異體目錄公布
有助深入認識基因功能 發現疾病相關基因

 

科技日報北京5月31日電 (記者張夢然) 英國《自然》《自然·通訊》《自然·醫學》雜志近日同時發表來自多家研究機構的一系列報告,集中描述了對一個匯集了逾14萬人樣本的數據庫——基因組聚集數據庫(gnomAD)的應用,該數據庫擁有迄今最大規模的人類遺傳變異體公開目錄,是我們深入認識人類基因功能、發現新疾病相關基因的寶貴資源。

人類基因組中絕大多數基因的功能依然未知。揭示基因功能的一種方法是觀察基因發生突變后的結果。這些變異體往往會產生不良結果,但通常較為罕見。大規?;驕y序研究有助于考察這些功能喪失型變異體的效應,或能帶來對人類生物學特征和疾病的重要見解。

此次《自然》發表的一篇概述性報告中,美國麻省理工學院—哈佛大學博德研究所科學家康拉德·卡澤維斯基及其同事,描述了從125748個全外顯子組和15708個全基因組測序數據集中鑒定出的443769個預測的功能喪失型變異體。鑒于這些變異體預計會影響其編碼蛋白的正常運作,團隊進而評估了這些變異體對生理機能的影響:究竟是幾乎沒有影響,還是會導致嚴重的健康問題?!蹲匀弧吠瑫r發表的另外兩篇報告,利用該數據庫創建了一個結構性變異體資源庫,并評估了基因缺失、復制,甚至是顛倒方向所產生的影響。

同時出爐的其他報告,探討了如何利用人類功能喪失型變異體評價候選藥物靶點,提升對遺傳變異體的臨床解讀,以及如何更詳細地考察特異性功能喪失型變異體。譬如英國帝國理工學院科學家尼古拉·威芬和同事分析了與帕金森病風險增加相關的一個基因的變異體,結果顯示靶向這個基因或是一種安全的治療方法。

科學家們表示,gnomAD項目的樣本量是其前任的兩倍多,之前的外顯子組聚集聯盟(ExAC)收錄了6萬多個外顯子組數據??删S斯基與同事也指出,他們距離鑒定出人類全部的預測功能喪失型變異體還很遙遠,盡管如此,他們認為這項資源能夠提升我們對罕見和常見遺傳病的評估。

 
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